حدثنا عبد الواحد بن محمد بن عبدوس النيسابوري رضي الله عنه قال حدثنا علي بن قتيبة عن الفضل بن شاذان قال: حدثني محمد بن أبي عمير انه سأل أبا الحسن عليه السلام عن حي على خير العمل لم تركت من الاذان؟ فقال تريد العلة الظاهرة أو الباطنة قلت أريدهما جميعا فقال: أما العلة الظاهرة فلئلا يدع الناس الجهاد اتكالا على الصلاة، واما الباطنة فان خير العمل الولاية فأراد من أمر بترك حي على خير العمل من الاذان ألا يقع حثا عليها ودعا إليها

Narrated by Muhammad ibn Abi Umayr that he asked Imam Musa Kazim (عليه السلام) about the reason why the words "Hasten to the best deed - حيّ على خير العمل" was removed from the Azaan. 

Imam Kazim (عليه السلام) said, "Do you want to know the apparent reason or the hidden (Batini) reason?"

The narrator said, "I want to know both of them."

Imam Kazim (عليه السلام) said, "As for the apparent reason - it was to ensure that people don’t leave Jihaad (fighting) relying upon Salaat (prayers).

And the hidden reason is that - "The best deed" is Wilayah, and by leaving out "حيّ على خير العمل" from the Azaan they wanted to ensure that there is no urge/insistence upon Wilayah and no call towards it."

[Source: Ilal Ash-Shara’e, Shaikh Sadooq, Vol.2, Pg. 368]

Meaning of "Hasten to the best of deeds - حي على خير العمل"

حدثنا علي بن عبد الله الوراق، وعلي بن محمد بن الحسن القزويني المعروف بابن مقبرة ، قال: حدثنا سعد بن عبد الله بن أبي خلف الأشعري، قال: حدثنا العباس ابن سعيد الأزرق، قال: حدثنا أبو نصر، عن عيسى بن مهران، عن الحسن بن عبد الوهاب عن محمد بن مروان، عن أبي جعفر عليه السلام قال: أتدري ما تفسير " حي على خير العمل "؟ قلت: لا. قال: دعاك إلى البر أتدري بر من؟ قلت: لا. قال: دعاك إلى بر فاطمة و ولدها عليهم السلام

Narrated that Abu Jafar Imam Baqir (عليه السلام) said,

"Do you know what is the meaning of "Hasten to the best of deeds - حي على خير العمل"?

I (the narrator) said, "No."

The Imam (عليه السلام) said, "He (Allah) has called you to do good/kindness. Do you know goodness to whom?"

I (the narrator) said, "No"

The Imam (عليه السلام) said, “"He (Allah) has called you to do good (show kindness) to Fatimah (عليها السلام) and Her Sons (عليهم السلام)."

[Source: Ma’ani al-Akhbar, Shaikh Sadooq, Pg. 42]